In de biologie is om een bepaald organisme te beschrijven, dat tot de koninkrijken van dieren, schimmels of planten behoort, een eigen nomenclatuur ontwikkeld. Het weerspiegelt het behoren tot één soort, afhankelijk van de kenmerken van morfologie en uiterlijk. Voor dieren worden de criteria voor het verwijzen naar een soort toegepast, afhankelijk van het vermogen om tijdens de bevruchting vruchtbare nakomelingen te produceren. Deze patronen zijn echter alleen van toepassing op deze organismen, terwijl microben niet op deze manier kunnen worden geclassificeerd.
Het concept van stam in de microbiologie
Vanwege de aanwezigheid van een groot aantal organismen met morfologische eigenschappen, maar verschillende biochemische en immunologische kenmerken, is het onmogelijk om standaardnomenclatuur voor naamgeving toe te passen. Als gevolg hiervan werd een concept als een soort geïntroduceerd. Dit is een zuivere cultuur van microben die op een bepaald uur op een bepaalde plaats is geïsoleerd en geïsoleerd.
Elke microbe die tot één stam behoort, is vergelijkbaar met een andere dergelijke vertegenwoordiger in termen van biochemische, morfologische, immunologische en genetische criteria. Maar binnen dezelfde bacteriesoort wordt een dergelijke analogie niet waargenomen. Daarom is een soort een flexibelere naam voor een microbiële cultuur. omdat snelde uitwisseling van genetisch materiaal (mutatie) leidt tot de opkomst van nieuwe organismen binnen een soort, maar met andere eigenschappen, het is deze definitie die ons in staat stelt om pathogeniteits- en virulentiefactoren nauwkeuriger te karakteriseren.
Bacteriële stammen
De bestaande nomenclatuur van bacteriën maakt het mogelijk om de soorten organismen te classificeren, maar kenmerkt hun nieuwe eigenschappen niet. Deze laatste verschijnen als gevolg van snelle mutatie, waardoor nieuwe eigenschappen worden verkregen, waaronder die pathogeen zijn voor mensen, landbouwhuisdieren en planten, evenals andere microben. Een voorbeeld van nomenclatuur met het voorbeeld van Escherichia coli ziet er als volgt uit: koninkrijk - bacteriën, type - Proteobacteria, klasse van gamma-proteobacteria, orde - Enterobacteriën, familie van Enterobacteria. Het geslacht is Escherichia en de soort is Escherichia colli. Er zijn echter veel culturen van bacteriën van de soort Escherichia colli, die verschillende eigenschappen vertonen. Ze worden geïsoleerd in afzonderlijke bacteriestammen en hebben een extra naam. Bijvoorbeeld Escherichia colli O157:H7.
E. coli zelf is aanwezig in de menselijke darm en veroorzaakt geen ziekte, maar de O157:H7-stam is uitsluitend pathogeen vanwege de aanwezigheid van een groot aantal virulentiefactoren. Ze heeft de afgelopen 5 jaar een epidemie van enterotoxigene ziekten meegemaakt.
Virussoorten
Het concept van een stam is een flexibele naam voor organismen met dezelfde eigenschappen die werden geïsoleerd en vervolgens op een bepaald moment in een bepaald gebied werden geïdentificeerd en beschreven. Met zijn loop kan het virus nieuwe eigenschappen krijgen door antigeendrift. Dit zal een nieuwe virale stam creëren, mogelijk pathogener dan zijn ouder.
Je kunt de opkomst van nieuwe stammen duidelijk laten zien aan de hand van het voorbeeld van het griepvirus. Het behoort tot de familie van Orthomyxovirussen en wordt genoemd afhankelijk van de antigenen (hemagglutinines en neuraminidase) HxNy. X en Y zijn numerieke waarden die de aanwezigheid van antigenen weerspiegelen. Een voorbeeld is H5N1, bekend van de recente varkensgriepepidemie met snel voortschrijdende hemorragische longontstekingen. Volgens de theorie kan uit deze stam een nieuwe en gevaarlijkere stam ontstaan door dezelfde antigene drift.
Schimmelstammen en protistenstammen
Schimmels zijn de minst variabele van alle microben, hoewel hun biochemie ook complex is. Door een complexere structuur dan bacteriën en virussen, en ook door het ontbreken van mechanismen voor snelle genoverdracht, neemt het aantal nieuwe schimmelstammen licht toe. Er is ook een mening dat elke nieuw ontdekte schimmelstam een reeds bestaand organisme is dat eenvoudigweg niet bij onderzoekers is overgekomen.
Een soortgelijke situatie bestaat in het koninkrijk van protisten. Hun vermogen om te muteren is laag, dus de kans dat er snel nieuwe soorten verschijnen is extreem klein. Er verschijnen echter nog steeds nieuwe varianten van organismen van dezelfde soort. Daarom bestonden ze blijkbaar ook eerder, maar werden ze niet ontdekt.
